From: HCV genotyping using statistical classification approach
 | Forward Primers | Reverse Primers | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | Start | End | Conservation Score (%) | Sequence | Start | End | Conservation Score (%) | Sequence |
NS5B | 8050 | 8074 | 93.2 | AGCCAGCTCGCCTTATCGTATTCCC | 8629 | 8605 | 94.5 | GCGGAATACCTGGTCATAGCCTCCG |
 | 8083 | 8107 | 89.1 | GGGTTCGTGTGTGCGAGAAGATGGC | 8800 | 8776 | 91.1 | ACTGGAGTGTGTCTAGCTGTCTCCC |
 | 8082 | 8106 | 89.0 | GGGGTTCGTGTGTGCGAGAAGATGG | 8634 | 8610 | 89.7 | GGGGGGCGGAATACCTGGTCATAGC |
 | 8125 | 8149 | 85.9 | CCACCCTTCCTCAGGCCGTGATGGG | 8633 | 8609 | 89.7 | GGGGGCGGAATACCTGGTCATAGCC |
 | 8124 | 8148 | 84.3 | TCCACCCTTCCTCAGGCCGTGATGG |  |  |  |  |
E1 | 709 | 733 | 94.1 | CATGCGGCTTCGCCGACCTCATGGG | 1612 | 1588 | 89.3 | TTCAGGGCAGTCCTGTTGATGTGCC |
 | 708 | 732 | 94.0 | ACATGCGGCTTCGCCGACCTCATGG | 1605 | 1581 | 89.3 | CAGTCCTGTTGATGTGCCAGCTGCC |
 | 733 | 757 | 93.0 | GGTACATTCCGCTCGTCGGCGCCCC | 1629 | 1605 | 83.2 | TGAGGCTGTCATTGCAGTTCAGGGC |
 | 821 | 845 | 91.2 | TGCAACAGGGAACCTTCCTGGTTGC |  |  |  |  |